وعادةً ما يتم اللجوء إِلى إجراءات زراعة الخلايا الجذعية ذاتية المنشأ في حال الأشخاص الذين يحتاجون إِلى الخضوع إِلى العلاج الكيميائي والإشعاعي بجرعات عالية لمداواتهم من الأمراض. ومن المرجح أن تؤدي طرق العلاج هذه إِلى تلف نخاع العظم. يساعد إجراء زراعة الخلايا الجذعية ذاتية المنشأ على استبدال نخاع العظم التالف.

يُستخدم إجراء زراعة الخلايا الجذعية ذاتية المنشأ عادة في علاج:

• لمفومة هودجكين
• الورم النقوي
• لمفومة اللاهودجكين
• اضطرابات الخلية البلازمية