يبدأ الطبيب تشخيص الورم القحفي البلعومي عادةً باستعراض السيرة المَرضية ومناقشة الأعراض. تشمل الاختبارات المستخدمة لتشخيص الورم القحفي البلعومي ما يلي:

• الفحص العصبي. يفحص اختصاصي الرعاية الصحية أثناء هذا الإجراء الإبصار والسمع والتوازن والتناسق وردود الأفعال اللا إرادية والنمو والتطور. ويمكن أن يساعد ذلك على تحديد الجزء المصاب بالورم من الدماغ.
• اختبارات الدم. قد تكشف اختبارات الدم عن تغيرات في مستويات الهرمونات التي تشير إلى وجود ورم يؤثر على الغدة النخامية.
• الاختبارات التصويرية. تلتقط الاختبارات التصويرية صورًا للدماغ. ويمكن لهذه الصور أن تُظهر حجم الورم ومكانه. وتشمل الاختبارات التصويرية الأشعة السينية والتصوير المقطعي المحوسب والتصوير بالرنين المغناطيسي. وفي بعض الحالات، قد يلزم إجراء اختبارات أخرى.